장르 - 액션,SF,드라마,애니메이션
감독 - 안노 히데아키,마사유키,츠루마키 카즈
출연 - 하야시바라 메구미,이시다 아키라,오가타 메구미,미야무라 유코,사카모토 마아야
줄거리 - 14년의 세월을 지나 깨어난 신지는, 미사토 등 전 네르프 대원들이 결성한 반네르프 조직 빌레의 전함 AAA 분더에 있다. 초호기에서 발견된 것은 신지 혼자였고, 아야나미 레이는 없었다. 하지만 신지 탈환을 위해 급습해 온 에반게리온 마크 나인으로부터 레이의 목소리를 들은 신지는 분더를 떠나 네르프로 향한다. 그곳에서 만난 나기사 카오루는 신지에게 변해버린 대지의 모습을 보여준다.